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上海拜力生物科技有限公司
Shanghai Bioleaf Biotech Co.,Ltd
電話 021-33779008
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郵編 201108
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文章詳情
載體構建技術服務|實驗技術服務
日期:2025-06-09 09:11
瀏覽次數:372
摘要:關鍵詞:載體構建技術服務|實驗技術服務
簡介:世界****載體構建技術服務|實驗技術服務原裝**,質量保證,價格優惠。
載體構建技術服務|實驗技術服務——pCzn1質粒+Arctic Express宿主菌低溫表達體系。
我們具備豐富的蛋白表達設計經驗及實驗操作技巧,承諾客戶不成功不收費。我們所有的實驗數據真實可信,我們提供原始的表達菌株和克隆質粒,客戶可以依據我們的實驗報告重復我們的實驗結果。
產品品牌:載體構建技術服務|實驗技術服務 http://www.gouwuze.com/goodsid/fenleiyi/2868603/1.html
測序實驗流程:
設計...
關鍵詞:載體構建技術服務|實驗技術服務
簡介:世界****載體構建技術服務|實驗技術服務原裝**,質量保證,價格優惠。
載體構建技術服務|實驗技術服務——pCzn1質粒+Arctic Express宿主菌低溫表達體系。
我們具備豐富的蛋白表達設計經驗及實驗操作技巧,承諾客戶不成功不收費。我們所有的實驗數據真實可信,我們提供原始的表達菌株和克隆質粒,客戶可以依據我們的實驗報告重復我們的實驗結果。
產品品牌:載體構建技術服務|實驗技術服務 http://www.gouwuze.com/goodsid/fenleiyi/2868603/1.html
測序實驗流程:
設計siRNA靶序列
在制備siRNA 前都需要單獨設計siRNA序列.研究發現對哺乳動物細胞,*有效的siRNAs是21-23個堿基大小、3’端有兩個突出堿基的雙鏈RNA;而對非哺乳動物,比較有效的是長片段dsRNA。siRNA的序列專一性要求非常嚴謹,與靶mRNA之間一個堿基錯配都會顯著削弱基因沉默的效果。
1. 選擇siRNA靶位點
從轉錄AUG起始密碼子開始,搜尋下游AA序列,記錄跟每個AA 3’端相鄰的19個核苷酸作為候選的siRNA靶位點。有研究結果顯示GC含量在30%-50%左右的siRNA要比那些GC含量偏高的更為有效。Tuschl等建議在設計siRNA時不要針對5'和3'端的非編碼區(untranslated regions,UTRs),原因是這些地方有豐富的調控蛋白結合區域,而這些UTR結合蛋白或者翻譯起始復合物可能會影響siRNP核酸內切酶復合物結合mRNA從而影響siRNA的效果
2. 序列同源性分析
將潛在的序列和相應的基因組數據庫(人或者小鼠、大鼠等等)進行比較,排除那些和其他編碼序列/EST同源的序列。例如使用BLAST( www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/)選出合適的目標序列進行合成.并非所有符合條件的siRNA都一樣有效,其原因還不清楚,可能是位置效應的結果,因此對于一個目的基因,一般要選擇3-5個靶位點來設計siRNA。
3. 設計陰性對照
一個完整的siRNA實驗應該有陰性對照,作為陰性對照的siRNA應該和選中的siRNA序列有相同的組成,但是和mRNA沒有明顯的同源性。通常的做法是將選中的siRNA中的堿基序列打亂。當然,同樣要保證它和其他基因沒有同源性。
合成模板
1. 合成編碼 shRNA的DNA 模板的兩條單鏈,模板鏈后面接有RNA PolyIII聚合酶轉錄中止位點,同時兩端分別設計 BamH I 和 Hind III 酶切位點,可以克隆到 siRNA 載體多克隆位點的 BamH I 和 Hind III 酶切位點之間。
2. 95℃,5 min,緩慢退火, DNA 單鏈得到 shRNA 的 DNA 雙鏈模板。
連接與轉化
1. 將100 μl感受態細胞于冰上解凍。
2. 取5 μl連接產物加入到感受態細胞中,輕輕旋轉幾次以混勻內容物,在冰上放置30分鐘。
3. 將管放入預加溫到42℃的水浴中,熱激90秒。快速將管轉移到冰浴中,使細胞冷卻1~2分鐘。
4. 每管中加700 μl LB培養基,37℃振蕩培養1小時,進行復蘇。
5. 室溫4 000 rpm離心5分鐘,棄去上清后,用剩余100 μl培養基重懸細胞并涂布到含抗性的LB瓊脂平板表面.注意:細胞用量應根據連接效率和感受態細胞的效率進行調整。
6. 將平板置于室溫直至液體被吸收。
7. 倒置平皿,于37℃培養,12~16小時后可出現菌落。
注意事項
1. 從轉錄本(mRNA)的AUG起始密碼開始,尋找“AA”二連序列,并記下其3’端的19個堿基序列,作為潛在的siRNA靶位點。有研究結果顯示GC含量在30%—50%左右的siRNA要比那些GC含量偏高的更為有效。
2. 將潛在的序列和相應的基因組數據庫(人,或者小鼠,大鼠等等)進行比較,排除那些和其他編碼序列/EST同源的序列。
3. 選出合適的目標序列進行合成。通常一個基因需要設計多個靶序列的siRNA,以找到*有效的siRNA序列。
4. 一個完整的siRNA實驗應該有負對照,作為負對照的siRNA應該和選中的siRNA序列有相同的組成,但是和mRNA沒有明顯的同源性。通常的做法是將選中的siRNA序列打亂,同樣要檢查結果以保證它和其他基因沒有同源性。
簡介:世界****載體構建技術服務|實驗技術服務原裝**,質量保證,價格優惠。
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我們具備豐富的蛋白表達設計經驗及實驗操作技巧,承諾客戶不成功不收費。我們所有的實驗數據真實可信,我們提供原始的表達菌株和克隆質粒,客戶可以依據我們的實驗報告重復我們的實驗結果。
產品品牌:載體構建技術服務|實驗技術服務 http://www.gouwuze.com/goodsid/fenleiyi/2868603/1.html
測序實驗流程:
設計siRNA靶序列
在制備siRNA 前都需要單獨設計siRNA序列.研究發現對哺乳動物細胞,*有效的siRNAs是21-23個堿基大小、3’端有兩個突出堿基的雙鏈RNA;而對非哺乳動物,比較有效的是長片段dsRNA。siRNA的序列專一性要求非常嚴謹,與靶mRNA之間一個堿基錯配都會顯著削弱基因沉默的效果。
1. 選擇siRNA靶位點
從轉錄AUG起始密碼子開始,搜尋下游AA序列,記錄跟每個AA 3’端相鄰的19個核苷酸作為候選的siRNA靶位點。有研究結果顯示GC含量在30%-50%左右的siRNA要比那些GC含量偏高的更為有效。Tuschl等建議在設計siRNA時不要針對5'和3'端的非編碼區(untranslated regions,UTRs),原因是這些地方有豐富的調控蛋白結合區域,而這些UTR結合蛋白或者翻譯起始復合物可能會影響siRNP核酸內切酶復合物結合mRNA從而影響siRNA的效果
2. 序列同源性分析
將潛在的序列和相應的基因組數據庫(人或者小鼠、大鼠等等)進行比較,排除那些和其他編碼序列/EST同源的序列。例如使用BLAST( www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/)選出合適的目標序列進行合成.并非所有符合條件的siRNA都一樣有效,其原因還不清楚,可能是位置效應的結果,因此對于一個目的基因,一般要選擇3-5個靶位點來設計siRNA。
3. 設計陰性對照
一個完整的siRNA實驗應該有陰性對照,作為陰性對照的siRNA應該和選中的siRNA序列有相同的組成,但是和mRNA沒有明顯的同源性。通常的做法是將選中的siRNA中的堿基序列打亂。當然,同樣要保證它和其他基因沒有同源性。
合成模板
1. 合成編碼 shRNA的DNA 模板的兩條單鏈,模板鏈后面接有RNA PolyIII聚合酶轉錄中止位點,同時兩端分別設計 BamH I 和 Hind III 酶切位點,可以克隆到 siRNA 載體多克隆位點的 BamH I 和 Hind III 酶切位點之間。
2. 95℃,5 min,緩慢退火, DNA 單鏈得到 shRNA 的 DNA 雙鏈模板。
連接與轉化
1. 將100 μl感受態細胞于冰上解凍。
2. 取5 μl連接產物加入到感受態細胞中,輕輕旋轉幾次以混勻內容物,在冰上放置30分鐘。
3. 將管放入預加溫到42℃的水浴中,熱激90秒。快速將管轉移到冰浴中,使細胞冷卻1~2分鐘。
4. 每管中加700 μl LB培養基,37℃振蕩培養1小時,進行復蘇。
5. 室溫4 000 rpm離心5分鐘,棄去上清后,用剩余100 μl培養基重懸細胞并涂布到含抗性的LB瓊脂平板表面.注意:細胞用量應根據連接效率和感受態細胞的效率進行調整。
6. 將平板置于室溫直至液體被吸收。
7. 倒置平皿,于37℃培養,12~16小時后可出現菌落。
注意事項
1. 從轉錄本(mRNA)的AUG起始密碼開始,尋找“AA”二連序列,并記下其3’端的19個堿基序列,作為潛在的siRNA靶位點。有研究結果顯示GC含量在30%—50%左右的siRNA要比那些GC含量偏高的更為有效。
2. 將潛在的序列和相應的基因組數據庫(人,或者小鼠,大鼠等等)進行比較,排除那些和其他編碼序列/EST同源的序列。
3. 選出合適的目標序列進行合成。通常一個基因需要設計多個靶序列的siRNA,以找到*有效的siRNA序列。
4. 一個完整的siRNA實驗應該有負對照,作為負對照的siRNA應該和選中的siRNA序列有相同的組成,但是和mRNA沒有明顯的同源性。通常的做法是將選中的siRNA序列打亂,同樣要檢查結果以保證它和其他基因沒有同源性。